Для отдельных конкретных практических целей правомерно использова­ние наиболее удобной для каждого случая группировки болезней. Так, для эпидемиологических целей удобна предложенная Э. Н. Шляховым классифи­кация зоонозов на основе приуроченности хозяев паразита к группам жи­вотных, по разному связанных с человеком: 1) зоонозы сельскохозяйственных и домашних животных, 2) зоонозы синантропных грызунов, 3) зоонозы диких животных. Группировка болезней на основе принадлежности возбудителей к роду и даже семейству — довольно частое явление в науках, изучающих ин­фекционную патологию. В этом случае в одну группу болезней, объединенных на основе филогенетической близости вызывающих эти болезни возбудителей, нередко включаются болезни из разных экологических групп (чтение схемы 2 не сверху вниз, а снизу вверх). Такой исходный филогенетический подход ча­сто применяют при описании риккетсиозов, иерсиниозов, заболеваний, вызы­ваемых псевдомонадами, вирусами оспенной группы и др.
Классификационные трудности определяются еще и тем, что при любом подходе к группировке биологических явлений и объектов непременно обнару­живаются промежуточные формы жизни, обусловленные эволюцией органиче­ского мира.