Основное показание — целесообразность применения, в частности:

• болевые синдромы нейрогенного и органического характера;
• нарушение микроциркуляции;
• нарушение иммунного статуса;
• сенсибилизация организма к лекарствам, аллергические проявления;
• заболевания воспалительного характера;
• необходимость стимулирования репаративных и регенеративных процессов в тканях;
• необходимость стимулирования систем регуляции гомеостаза (рефлексотерапия).

Если касаться урологии, то это: острый и хронический пиелонефрит, мочекаменная болезнь, цистит, уретриты; простатиты, патология сперматогенеза, болезнь Пейрони; невротические сексуальные расстройства и др.
Противопоказания:

• сердечно-сосудистые заболевания в фазе декомпенсации;
• нарушение мозгового кровообращения II степени;
• легочная и легочно-сердечная недостаточность в фазе декомпенсации;
• злокачественные новообразования;
• доброкачественные образования со склонностью к прогрессированию;
• заболевания нервной системы с резко повышенной возбудимостью;
• лихорадки невыясненной этиологии;
• заболевания кроветворной системы;
• печеночная и почечная недостаточность в стадии декомпенсации;
• сахарный диабет в стадии декомпенсации;
• гипертиреоз;
• беременность во всех сроках;
• психические заболевания в стадии обострения;
• повышенная чувствительность к светолечению (фотодерматит и фотодерматоз, порфириновая болезнь, дискоидная и системная красная волчанка).

Необходимо заметить, что абсолютных специфических противопоказаний для лазерной терапии нет. Однако в зависимости от состояния пациента, фазы течения заболевания и др. возможны ограничения использования НИЛИ.