В крупных городах существуют центры трансплантации (в Москве — Научно-исследовательский институт трансплантологии и искусственных органов), при которых организованы центры забора органов. Такие центры могут быть созданы и при крупных многопрофильных стационарах.
Представители центров забора контролируют ситуацию в реанимационных отделениях региона, оценивая возможность использования находящихся в критическом состоянии пациентов для забора органов. При констатации смерти мозга пациент переводится в центр трансплантации, где осуществляется изъятие органов для пересадки, или на место выезжает специальная бригада, производящая изъятие органов в стационаре, где находится пострадавший.
Учитывая большую потребность в органах для пересадки, а также дефицит доноров, наблюдаемый во всех экономически развитых странах, после констатации смерти мозга обычно осуществляют комплексное изъятие органов для их максимального использования.
Правила изъятия органов:

• изъятие органов осуществляется при строжайшем соблюдении всех правил асептики,
  
• орган изымается вместе с сосудами и протоками с максимально возможным их сохранением для удобства наложения анастомозов (почечные сосуды выкраивают вместе с участком стенки аорты и нижней полой вены и т. д.),
• после изъятия орган перфузируется специальным раствором (в настоящее время для этого используют раствор Евро-Коллинз при температуре 6-10°С),
• после изъятия орган сразу же имплантируют (если параллельно в двух операционных идут операции по забору органа у донора и доступ — или удаление собственного органа — у реципиента) или помещают в специальные герметичные пакеты с раствором Евро- Коллинз и хранят при температуре 4~6°С.