ДОБИОЛОГИЧЕСКАЯ СИСТЕМА НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
Возникновение системы нуклеиновых кислот. Многие исследователи, занимающиеся вопросами происхождения жизни, считали, что переход от органических молекул к организованной клеточной структуре происходит в несколько этапов. Начальной этап — образование макромолекул, аналогичных тем, которые содержатся в живых системах. В первую очередь под этим углом зрения были рассмотрены белки. Действительно, было показано, что аминокислоты могут возникать из составляющих их атомов в результате простых физических процессов и что из аминокислот могут образовываться белковоподобные полипептиды (протеиноиды) в условиях, по-ви- димому, аналогичных условиям, существовавшим в первичном бульоне [19]. Однако никто еще до сих пор не предложил механизма, посредством которого могли бы реплицироваться белки, образовавшиеся случайным образом. Поскольку существует известный механизм репликации полинуклеотидов, вполне правдоподобным представляется предположение, что первый этап возникновения жизни — это образование полинуклеотидов.
Можно предположить, что первичный питательный бульон, вероятно существовавший до того, как живые организмы исчерпали наличные органические молекулы, должен был содержать пурины, пиримидины, сахара, фосфаты и даже нуклеотиды, а быть может, и трифос- фаты нуклеозидов. Из таких строительных блоков может образоваться однонитевой полинуклеотид. Эта реакция будет идти in vitro в присутствии ферментов. Протекает она довольно медленно — для завершения реакции требуется около получаса (считая с момента приготовления соответствующей смеси); но если та же реакция будет идти без помощи какого-либо катализатора, то она может потребовать для своего осуществления 5000 000 лет (допуская, что указанный выше множитель равен 10ш). Однако нельзя считать, что это условие исключает вероятность такого процесса, так как длительность добиологического периода Земли примерно в 400 оач превышает указанный срок. Кроме того, облегчать полимеризацию могли бы и некоторые неорганические катализаторы, содержащиеся в прибрежных участках моря. Все это, конечно, весьма неопределенные рассуждения, но здесь существенно следующее: образование однонитевых полинуклеотидов вполне совместимо с тем, что могло бы произойти при наличии достаточного числа шансов. Таким образом, хотя самопроизвольное образование полинуклеотидов, по-видимому, и менее вероятно, чем возникновение полипептидов, оно достаточно вероятно, чтобы произойти в результате реализации небольшой доли всего множества шансов. В отличие от белков для полинуклеотидов можно предположительно наметить этапы, которые вели бы в результате ряда вероятных превращений от макромолекулы к некой системе, обладающей рядом характеристик, близких к биологическим.
Как правило, полимеризация однонитевого полинуклеотида идет медленно, а его гидролиз — быстро. Следовательно, в замкнутой системе, содержащей только нуклеотиды и их однонитевые полимеры, лишь небольшая часть наличных молекул будет находиться в полимерной форме. Однако однонитевой полимер может превратиться в двунитевой в результате комплементарной полимеризации (т. е. полимеризации на комплементарной матричной цепи) с однонитевым полинуклеотидом в роли матрицы. Этот процесс идет довольно быстро, и образующийся полинуклеотид оказывается значительно более стабильным, чем однонитевой, так как в нем не только каждый мономер связан с соседними (в углеводно-фосфатном остове), но и две нити связаны друг с другом через основания, входящие в состав мономеров. Возможно, что в присутствии двойных нитей и нуклеотидов могут образовываться тройные нити в результате полимеризации вдоль двунитевой матрицы или четверные нити — в результате одновременной репликации Обоих компонентов двойной нити [3, 30].
Двунитевой полинуклеотид может диссоциировать на два однонитевых, и наоборот, две отдельные нити с почти комплементарными последовательностями оснований могут объединяться в двунитевой полинуклеотид (это подтверждается опытами по гибридизации ДНК с комплементарной РНК). Кроме того, трехнитевой полимер может превращаться в одно- и двунитевой, и наоборот— эти два могут образовывать тройную нить. Таким образом, если какая-либо система содержит нуклеотиды и полимеры с комплементарными последовательностями оснований, то в ней могут происходить следующие превращения: 1) одиночные нити соединяются в двойные (|ассоциация); 2) двойные нити распадаются, образуя одиночные (диссоциация); 3) двойные нити образуются — в результате полимеризации — из одиночных нитей и нуклеотидов; 4) нуклеотиды образуются в результате гидролиза одиночных нитей.
Превращения трех других типов — прямая полимеризация одиночных и двойных нитей из нуклеотидов и гидролиз двойных нитей — происходят относительно медленно, ,и их можно не учитывать. Учет трехнитевых и че- тырехнитевых полимеров несколько усложняет общую картину, но не может добавить к ней каких-либо важных особенностей.
Такого рода примитивная система нуклеиновых кислот содержит однонитевые полимеры двух типов: один— с последовательностью оснований, тождественной первоначально установившейся, и другой — с комплементарной последовательностью. Сложность всей системы может существенно увеличиться в результате появления таких двойных нитей, у которых концы слились с одной стороны. Это слияние может осуществиться с помощью мостика из трех нуклеотидов [34]. Можно представить себе, что слияние цепочек происходит в результате добавления каких-то случайных мономеров после завершения комплементарной полимеризации (в этом случае новые мономеры присоединяются за пределами матричной цепи); можно также допустить, что оно возникает в процессе комплементарной полимеризации: какой-то мономер не смог найти себе партнера, в результате чего возникла боковая цепь из случайных мономеров, которая после складывания вдвое может подвергнуться комплементарной полимеризации. Возможно, что слияние нитей происходит и каким-нибудь другим способом. Независимо от причины такое слияние всегда означает следующее: образовавшаяся в результате диссоциации молекула представляет собой однонитевой полимер, у которого последовательность оснований в одном участке нити комплементарна этой последовательности в другом ее участке, если не считать трех нуклеотидов, образующих мостик. Такой однонитевой полимер нового типа должен обладать способностью к гидролизу, к комплементарной полимеризации, а также к соединению (ассоциации) с комплементарной однонитевой структурой.
Фиг. 1. А — исходный однонитевой полимер (нуклеиновая кислота); стрелки указывают порядок чередования 3'- и 5'-фосфоэфир ных связей. СА — комплементарная последовательность оснований во втЬрой одиночной цепи, полимеризующейся на первой цепи с образованием двойной структуры. В — «мостик» из трех мономеров, соединяющий концы двойной цепи, которая может затем развернуться, образуя новую одиночную цепь, и т. д. СВ — последовательность, комплементарная «мостику». |
Кроме того, он должен обладать способностью к свертыванию и развертыванию (фиг. 1).
Стабильность системы нуклеиновых кислот. Система, содержащая только нуклеотиды и однонитевые полимеры, не способна к самовоспроизведению. При значительном избытке нуклеотидов всегда будут присутствовать однонитевые полимеры, но они будут представлять собой случайные, статистические, цепочки, не похожие друг на друга. Здесь и в дальнейшем мы будем предполагать, что не существует механизма, помогающего созданию какой-то определенной последовательности оснований. Такие механизмы могли бы существовать [28], но
не было найдено ни одного, который заметно помогал бы возникновению какой-либо определенной последовательности. Наличие незначительного преимущества у одной последовательности по сравнению с другой не изменяет приводимой здесь аргументации, допускающей, что первые образовавшиеся последовательности оснований случайны. Действительно, если даже какой-то неизвестный закон полимеризации и определяет исходную последовательность, то каков бы ни был этот закон, он не будет действовать в дальнейших актах комплементарной полимеризации, ассоциации и диссоциации. (Отметим возможность существования некой особой одиночной нити, относительно легко образующейся из отдельных строительных блоков; если это образование происходит с частотой, сравнимой с частотой возникновения одиночных нитей в результате расщепления двойных, то такая система, конечно, должна быть стабильной — стабильной без какого-либо участия механизма образования двойных нитей. Возможны и другие, совершенно особые случаи. Например, какая-либо нить, содержащая длинную последовательность элементов Г1, за которой следует столь же длинная последовательность элементов Ц1, будет стремиться сложиться вдвое и после этого не будет проявлять тенденции к диссоциации, что должно препятствовать комплементарной полимеризации «1— 2».)
Комплементарная полимеризация обеспечивает как возможность репликации, так и большую стабильность системы. Рассмотрим замкнутую систему, содержащую нуклеотиды Ы, однонитевые полимеры (каждый из них состоит из Р нуклеотидов) и двунитевые полимеры Ра (фиг. 2). Тогда разрешенные переходы запишутся в виде Г идролиз:
т. е.и т. д., то рассматриваемая система бу
дет стабильной при наличии трех компонентов только тогда, когда ‘‘ т. е. когда однонитевой полимер
одинаково легко способен как полимеризоваться, так и гидролизоваться. В противоположном случае в системе израсходуется либо все количество, либо все количество(разобщает .). Если Iилиивме
сте лимитируют скорость реакции, то система достигнет стационарного состояния при наличии всех трех компонентов,
Если нуклеотиды непрерывно удаляются, то гидролиз одиночных нитей приведет в нашей системе к необратимым потерям. Концентрация полимеров снизится; однако скорость их распада может существенно уменьшиться в результате ассоциации однонитевых полимеров в двунитевые. При добавлении избытка нуклеотидов, напротив, начинает идти реакция полимеризации; концентрация полимеров увеличивается, и, поскольку при этом появляются новые однонитевые полимеры, избыточные нуклеотиды будут потребляться со все возрастающей скоростью. Таким образом, оказывается, что наша система будет слабо реагировать на флуктуацию запаса нуклеотидов. Она будет расти или распадаться лишь при непрерывном увеличении или уменьшении этого запаса.
Появление трех- или четырехнитевых полимеров приводит как к увеличению числа соответствующих устойчивых конфигураций, так и к возрастанию вероятности наступления комплементарной полимеризации. Слияние цепей, сопровождаемое обратимым свертыванием и развертыванием, служит еще одной, вероятно чрезвычайно мощной, защитой от потерь Рг в результате гидролиза.
Протобиологические системы. Описанная выше система обладает одним основным свойством, присущим живым организмам, а именно способностью к самовоспроизведению. В ней не происходит истинного метаболизма, хотя она и поглощает строительные блоки, содержащиеся в окружающей ее среде. Эта система способна мутировать, так как отдельные основания могут претерпевать изменения, которые затем закрепляются наследственно. Системы нуклеиновых кислот могут конкурировать друг с другом за строительные блоки («предшественники»). Система, случайно принявшая трехните- вую конфигурацию или конфигурацию свернутой цепи, обладает большей стабильностью, чем система, не претерпевшая такого превращения. Если и та и другая находятся в среде, содержащей ограниченный запас нуклеотидных строительных блоков, то первая из этих систем выиграет соревнование с менее сложной системой и вытеснит ее. При наличии значительного избытка нуклеотидов соревнование может выиграть система с меньшим числом стабильных состояний, так как она быстрее усваивает необходимые ей вещества. Конечно, при любом наборе условий, в значительной степени определяемых запасом нуклеотидов, существует какое-то оптимальное соотношение между стабильными и менее стабильными конфигурациями. Стабильность определяется в основном числом имеющихся стабильных конфигураций, но она может изменяться и постепенно (не столь резким образом) в результате мутаций, влияющих на соотношение констант ассоциации и диссоциации, а также свертывания и развертывания. Таким образом, система нуклеиновых кислот, по-видимому, способна даже к эволюции в дарвиновском смысле, правда на особом, примитивном уровне.
Приведенные выше рассуждения весьма поверхностны, но нам представляется вероятным, что системы нуклеиновых кислот могли бы возникать в первичном бульоне, содержащем строительные блоки, и что в результате образования таких систем окружающая их среда очень быстро могла бы превратиться в местообитание строго определенных и стабильных молекулярных систем, которые конкурировали бы друг с другом, а также обладали мутабильностью и зачаточной приспособляемостью. Поэтому отнюдь не исключено, что важный этап в возникновении биологической организации мог осуществиться без участия каких-либо маловероятных событий.
Источник: Г. Касмлер, «ВОЗНИКНОВЕНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ОРГАНИЗАЦИИ» 1967