При типичном течении болезни диагностика не вызывает затруднений. При менее очерченной клинике большим подспорьем оказываются эпидемиологический анамнез и эпизоотологические данные.

Лабораторная диагностика:

• Выделение вируса осуществляют из крови, слюны, афтозных элементов и фекалий. Лучшим диагностическим тестом является биологическая проба: содержимое афт втирают в подушечки лапок морских свинок. При наличии вируса ящура у подопытного животного появляются характерные афтозные элементы.

• Серологические исследования проводят с помощью РСК и РИГА в парных сыворотках с промежутком в 6-8 дней. Диф. диагн. с афтозным стоматитом, герпетической инфекцией, ветряной оспой, энтеровирусными заболеваниями, пемфигусом, токсическим и кандидозным стоматитом.