ТИПЫ АКТИВНОСТИ НУКЛЕИНОВЫХ кислот В КЛЕТКАХ
Перечень типов активности. Некоторые, а может быть и все, функции нуклеиновых кислот в клетке легко объяснить элементарными действиями предбиологической системы — гидролизом, комплементарной полимеризацией, ассоциацией и диссоциацией.
5) Ассоциация информационной РНК с рибосомами. Механизм этого процесса неизвестен. Поскольку процесс неспецифичен, механизм его, вероятно, аналогичен механизму ассоциации нуклеиновых кислот с полимеразой.
Примером активности, в которой могут участвовать, но могут и не участвовать нуклеиновые кислоты, является репрессия или дерепрессия определенного участка генома. Если этот процесс осуществляется нуклеиновыми кислотами, то он включает специфическую ассоциацию и последующую диссоциацию. Поскольку репрессирующий агент способен диффундировать, эту роль должна выполнять РНК (если только это вообще нуклеиновая кислота); другой нитью может служить информационная РНК гена, находящегося в состоянии репрессии, или сама ДНК, если матричная цепь или какая-то комплементарная цепь участвует в механизме освобождения информационной РНК [22].
6) Репрессия: ассоциация или
7) Дерепрессия-, диссоциацияили
Различие между гипотетической «предбиологической» и современной системой состоит в том, что большинство перечисленных выше процессов катализируется теперь
ферментами. Связь между нуклеиновыми кислотами и ферментами практически неспецифична, т. е. не зависит от специфичности какой-то определенной последовательности оснований. Однако она должна быть очень тонкой. На это указывают следующие данные: при комплементарной полимеризации in vitro воспроизводятся многие особенности, характерные для этого процесса in vivo, но все же не все; синтез ДНК и РНК, по-видимому, сопровождается конкуренцией за матрицу; высокую избирательность спаривания оснований информационной и транспортной РНК (в процессе синтеза белка) нельзя объяснить, исходя из одного лишь механизма образования пар, предложенного Уотсоном и Криком.
Состояния ДНК. Если мы действительно перечислили выше все существующие типы активности нуклеиновых кислот, то генетическая ДНК всегда должна находиться в одном из следующих пяти состояний:
1. В состоянии репликации. Репликация осуществляется в результате комплементарной полимеризации, катализируемой ДНК-полимеразой.
2. В состоянии, в котором она продуцирует РНК. Этот процесс осуществляется в результате комплементарной полимеризации, катализируемой РНК-полимера- зой.
3. В состоянии динамической репрессии, вызванной специфической ассоциацией с репрессорной РНК.
4. В состоянии статической репрессии; такое состояние просто постулируется, поскольку в клетках высших организмов подавляющая часть генов остается большую часть времени неактивной и, конечно, было бы крайне неэкономично, если бы это достигалось за счет динамической репрессии.
5. В свободном состоянии, в которое ДНК переходит после завершения процессов 1 и 2 или после дерепрессии, вызванной диссоциацией; свободное состояние следует считать весьма неустойчивым (переходным).
Вероятно, обычно имеют место следующие переходы:
Состояния РНК. РНК встречается в трех видах: в виде гибрида РНК—ДНК, в свободном виде и в соединении с рибосомами. Кроме того, будучи более лабильной, нежели ДНК, она находится в равновесии с фондом предшественников. На схеме, приведенной на фиг. 9,
показаны состояния и переходы из одного состояния в другое, а также связанные с ними функции нуклеиновых кислот.
Эта схема содержит все элементы, необходимые для объяснения той части контроля генной активности, которая связана с нуклеиновыми кислотами. Единственное усложнение, которое следует внести, обусловлено тем, что некоторые молекулы РНК должны будут взаимодействовать не с теми генами, которые служили их матрицами.
5) Ассоциация информационной РНК с рибосомами. Механизм этого процесса неизвестен. Поскольку процесс неспецифичен, механизм его, вероятно, аналогичен механизму ассоциации нуклеиновых кислот с полимеразой.
Примером активности, в которой могут участвовать, но могут и не участвовать нуклеиновые кислоты, является репрессия или дерепрессия определенного участка генома. Если этот процесс осуществляется нуклеиновыми кислотами, то он включает специфическую ассоциацию и последующую диссоциацию. Поскольку репрессирующий агент способен диффундировать, эту роль должна выполнять РНК (если только это вообще нуклеиновая кислота); другой нитью может служить информационная РНК гена, находящегося в состоянии репрессии, или сама ДНК, если матричная цепь или какая-то комплементарная цепь участвует в механизме освобождения информационной РНК [22].
6) Репрессия: ассоциация или
7) Дерепрессия-, диссоциацияили
Различие между гипотетической «предбиологической» и современной системой состоит в том, что большинство перечисленных выше процессов катализируется теперь
ферментами. Связь между нуклеиновыми кислотами и ферментами практически неспецифична, т. е. не зависит от специфичности какой-то определенной последовательности оснований. Однако она должна быть очень тонкой. На это указывают следующие данные: при комплементарной полимеризации in vitro воспроизводятся многие особенности, характерные для этого процесса in vivo, но все же не все; синтез ДНК и РНК, по-видимому, сопровождается конкуренцией за матрицу; высокую избирательность спаривания оснований информационной и транспортной РНК (в процессе синтеза белка) нельзя объяснить, исходя из одного лишь механизма образования пар, предложенного Уотсоном и Криком.
Состояния ДНК. Если мы действительно перечислили выше все существующие типы активности нуклеиновых кислот, то генетическая ДНК всегда должна находиться в одном из следующих пяти состояний:
1. В состоянии репликации. Репликация осуществляется в результате комплементарной полимеризации, катализируемой ДНК-полимеразой.
2. В состоянии, в котором она продуцирует РНК. Этот процесс осуществляется в результате комплементарной полимеризации, катализируемой РНК-полимера- зой.
3. В состоянии динамической репрессии, вызванной специфической ассоциацией с репрессорной РНК.
4. В состоянии статической репрессии; такое состояние просто постулируется, поскольку в клетках высших организмов подавляющая часть генов остается большую часть времени неактивной и, конечно, было бы крайне неэкономично, если бы это достигалось за счет динамической репрессии.
5. В свободном состоянии, в которое ДНК переходит после завершения процессов 1 и 2 или после дерепрессии, вызванной диссоциацией; свободное состояние следует считать весьма неустойчивым (переходным).
Вероятно, обычно имеют место следующие переходы:
Состояния РНК. РНК встречается в трех видах: в виде гибрида РНК—ДНК, в свободном виде и в соединении с рибосомами. Кроме того, будучи более лабильной, нежели ДНК, она находится в равновесии с фондом предшественников. На схеме, приведенной на фиг. 9,
Фиг. 9. |
показаны состояния и переходы из одного состояния в другое, а также связанные с ними функции нуклеиновых кислот.
Эта схема содержит все элементы, необходимые для объяснения той части контроля генной активности, которая связана с нуклеиновыми кислотами. Единственное усложнение, которое следует внести, обусловлено тем, что некоторые молекулы РНК должны будут взаимодействовать не с теми генами, которые служили их матрицами.
Источник: Г. Касмлер, «ВОЗНИКНОВЕНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ОРГАНИЗАЦИИ» 1967