КОМПЬЮТЕР ВМЕСТО ПРОБИРКИ(геноинформатика)

Конечно, обдумывай «что»,
но еще больше обдумывай «как».
И. Гёте
Одной из особенностей, характерных для многих современных наук, включая и генетику, заключается в активном использовании в ней передовых достижений информационных технологий. Секве–нирование генома человека и развитие такого направления, как ге–номика, пришлось на то время, которое по праву называют информационным. И все это произошло не случайно.
Многие ученые отмечают, что никогда еще в биологии не было такого положения дел, как сейчас. Раньше у нас было мало фактов, но существовало огромное количество гипотез, что соответствовало известному закону Мэрфи. Но теперь, благодаря успехам в определении генома человека и ряда других организмов, генетика из относительно бедной фактами превратилась в чрезвычайно богатую информацией науку. Энциклопедия под названием «Геном человека», которую «восстановили» из небытия на рубеже двух тысячелетий, содержит такой гигантский объем информации, который просто невозможно переварить человеческому мозгу. Издавать ее в печатном виде не имеет никакого смысла – ведь никто не в состоянии ее прочесть и понять. И здесь на помощь человеку пришли компьютеры. На этой основе появилось новое направление в науке биоинформатике – компьютерная геномика, которая призвана с помощью математических методов понять и осмыслить всю ту информацию, которая содержится в Энциклопедии человека.
В течение многих лет изучение генов и их функций основывалось на экспериментах в системах in vivo ( в живом) и in vitro ( в пробирке). Лишь в 80–х годах на помощь экспериментаторам пришло мощное дополнение – компьютер. Появилось и свое латинское обозначение для этого подхода – in silico, то есть в компьютере. Компьютеры были сконструированы еще в 60–е годы, но тогда они были лишь вспомогательным средством для обработки и хранения ограниченного объема данных. Техника постепенно совершенствовалась, и с конца 80–х началось создание баз данных, в которых теперь хранится информация о миллионах последовательностей нуклеотидов в ДНК и РНК и об огромном числе последовательностей аминокислот в белках.
Однако вся эта огромная информация в значительной мере была бы бесполезной без ее упорядочения и систематизации, подобно тому, как без инвентаризации книг в гигантских книгохранилищах просто невозможно найти нужную нам книгу. Компьютерная гено–мика стала заниматься тем же, чем до того занимались классическая биохимия и молекулярная биология, но не с использованием пробирки, а с помощью специальной компьютерной техники. Этот подход иногда называют «сухой» биохимией.

к содержанию

Источник: Вячеслав Залманович Тарантул, «Геном человека: Энциклопедия, написанная четырьмя буквами» 2003

КОМПЬЮТЕР ВМЕСТО ПРОБИРКИ(геноинформатика)

А так же в разделе « КОМПЬЮТЕР ВМЕСТО ПРОБИРКИ(геноинформатика) »