В настоящее время отсутствуют достоверные данные о частоте ВУИ, так как диагностика ВУИ связана с определенными трудностями и тотального скрининга на ВУИ нет ни в одной стране мира. Большая часть инфекционных болезней беременных, приводящих к внутриутробному инфицированию, протекает в субклинической форме или бессимптомно, что значительно затрудняет диагностику ВУИ. В 50% случаев инфекционная патология среди новорожденных скрывается за такими диагнозами, как внутриутробная гипоксия, анте- или интранатальная асфиксия, пневмопатия, сепсис, родовая травма, пороки развития и др. Установлено, что в период новорожденности диагностируется только 15-20% врожденной патологии. Большая часть врожденной патологии выявляется только на первом году жизни или в более позднем возрасте.
По литературным данным, частота ВУИ варьирует от 2,0-6,0% до 21-37-58%, основная часть авторов указывает 10%. При этом в публикациях даются показатели без учета различий между внутриутробными инфекциями
и внутриутробным инфицированием. В последние годы отмечается рост заболеваемости ВУИ среди новорожденных детей. По данным иссле­дователей, в структуре детской смертности ВУИ составляют 11-28-37-45% и более, находясь на 3 месте после ОРЗ и ВПР. В структуре антенатальной смертности вследствие внутриутробной инфекции 27,2% приходится на вирусную инфекцию, 26,3% на смешанную и 17,5% на бактериальную.
ЦМВИ является одной из наиболее частых врожденных инфекций и встречается у 0,2-2,5-3% и до 10% новорожденных детей. В Европе частота врожденной ЦМВИ составляет 3-5 на 1000 родов. Данные о частоте неонатального герпеса существенно колеблются: от 1,65 до 50 случаев на 100000 новорожденных, по другим данным - от 1:500 - 1:5000 до 1:60000 живорожденных; в Англии - 1 случай на 40 тысяч родов, тяжелых форм - 1 случай на 200 тысяч живорожденных; в США - 1 случай на 2500-10000 живорожденных. Смертность от неонатального герпеса достигает 50-70%, здоровыми остаются только 15% детей, остальные страдают тяжелыми неврологическими заболеваниями. Перинатальная ВЭБИ достигает 17,4%. Частота врожденного токсоплазмоза составляет от 1 до 10 на 1000 рождений. Заболеваемость хламидийной инфекцией новорожденных колеблется от 0,5 до 7% живорожденных детей. Частота внутриутробной микоплазменной инфекции колеблется от 3 до 59%. Заболеваемость новорожденных в результате внутриутробного инфицирования уреаплазмой составляет от 5,3 до 32,6%.
В соответствии с официальными данными по РФ в 2015 г. зарегистрировано 3663 случая ГСИ новорожденных. Отмечено, что в многолетней динамике увеличивается соотношение внутрибольничных ГСИ новорожденный и внутриутробных инфекций новорожденных, в целом по стране в 2015 г. оно составило 1:8,3, что выше аналогичного показателя 2014 г. - 1:7,1 (2013 г. - 1:6,9). При этом в разрезе субъектов РФ отмечается значительный разборс значений этого соотношения. Территориями, на которых этот показатель значительно превышает среднероссийский, являются Краснодарский край - 1:233, г. Москва - 1:51, Республика Мордовия - 1:33, Ставропольский край - 1:41, Чувашская Республика - 1:40, Красноярский край - 1:26, Смоленская - 1:99, Волгоградская - 1:77, Тамбовская - 1:66, Белгородская - 1:53, Кировская - 1:39, Новосибирская - 1:26, Амурская - 1:24, Астраханская - 1:22, Саратовская - 1:21, Курская - 1:17 области, Ханты-Мансийский автономный округ-Югра - 1:20.
В Магаданской области и г.Севастополе при отсутствии ГСИ новорожденных регистируются только внутриутробные инфекции.