Классификация вирусов 


На сегодня главным критерием в таксономии вирусов являются: 1) тип и структура вирусного генома 2) стратегия репликации вируса 3) структура вириона. Полное или частичное секвенирование вирусного генома увеличивает таксономическую информацию и очень часто используется с целью идентификации вируса. Сведения о нуклеотидной последовательности для всех таксономических групп вирусов имеются в опубликованной базе данных (Генбанк, Национального Центра биотехнологической информации, Национальной медицинской лаборатории, Национального Института здоровья, Бетезда, Мериленд, США). Это достижение в большинстве случаев укорачивает таксономическую идентификацию, хотя традиционные методы все еще часто используются по экономическим соображениям. Универсальная система таксономии вирусов включает несколько уровней: порядок, семейство, подсемейство, род и вид. Патогенные вирусы позвоночных (человека и животных) в соответствии с современной системой классификации вирусов объединены в 2 (Mononegavirales и Nidovirales) порядка и 28 семейств, из которых 10 являются ДНК-вирусами и 18 РНК-вирусами.

Семейство

Подсемейство

Род

Типовой вид

ДНК-вирусы

Вирусы оспы

Вирусы

Ортопоксвирусы

Вирус вакцины


ОСПЫ
хордовых

Парапоксвирусы

Вирус орф (контагиозного пустулезного дерматита овец-эктимы)



Авипоксвирусы

Вирус оспы кур



Лепорипоксивирусы

Вирус миксомы кроликов



Суипоксвирусы

Вирус оспы свиней



Каприпоксвирусы

Вирус оспы овец



Ятапоксивирусы

Вирус опухолей обезьян Яба



Молюсцивирусы

Вирус контагиозного моллюска

Асфаро-
вирусы


Асфивирусы

Вирус африканской чумы свиней

Иридовирусы


Рановирусы

Вирус лягушек 3



Лимфоцистивирусы

Вирус лимфоцитоза рыб

Герпесвирусы

Альфагерпес-

Простые герпесвирусы

Вирусы герпеса человека 1


вирусы

Варицелловирусы

Вирусы герпеса человека 3



Вирусы, подобные вирусу болезни Марека

Вирус болезни Марека



Вирусы, подобные вирусу ларинготрахеита птиц

Герпесвирус птиц 1


Бетагерпес-

Цитомегаловирусы

Герпесвирус человека 5


вирусы

Муромегаловирусы

Цитомегаловирус мышей 1



Розеоловирусы

Герпесвирус человека 6


Гаммагерпес-

Лимфокриптовирусы

Герпесвирус человека 4 и*


вирусы

Радиновирусы

Герпесвирус обезьян 2


Герпесподоб- ные вирусы

Герпесподобные вирусы

L

Аденовирусы

Мастаде-
вирусы


Аденовирус человека 2


Авиадено-
вирус


Аденовирус птиц 1


Неклассифи
цированные
аденовирусы

!


Полиома-
вирусы


Полиомавирусы

Вирус обезьян SV40


Семейство

Подсемейство

Род

Типовой вид

Папиллома-
вирусы


Папиломавирусы

Вирус папилломы кроликов

Цирковирусы


Цирковирусы

Вирус анемии цыплят

Парвовирусы

Парвовирусы

Парвовирусы

Мелкий вирус мышей



Эритровирусы

Вирус В19



Депендовирусы

Адено-ассоциированные вирусы человека и обезьян 2

Гепадно-


Ортогепаднавирусы

Вирус гепатита В человека

вирусы


Авигепаднавирусы

Вирус гепатита В уток

РНК-вирусы

Ретровирусы


Ал ьфаретро вирус ы (морфология вирионов С-типа)

Вирус лейкоза птиц



Бетаретровирусы (морфология вирионов В и Д-типа)

Вирус опухоли молочной железы мышей



Гаммаретровирусы (морфология вирионов С-типа)

Вирус лейкемии мышей



Дельтаретровирусы (морфология вирионов С-типа). Вирус лейкоза К PC и Т-лимфотропные вирусы человека и обезьян.

Вирус лейкоза крупного рогатого скота



Эпсилонретровирусы (ретровирусы рыб; морфология вирионов С-типа)

Вирус дермальной саркомы окуневых рыб



Лентивирусы (вирусы иммунодефицита человека и животных; вирио- ны цилиндрической или конической формы)

Вирус иммунодефицита человека 1



Спумавирусы

Пенящий вирус обезьян

Реовирусы


Ортореовирусы

Ортореовирус
млекопитающих



Орбивирусы

Вирус синего языка овец



Ротавирусы

Ротавирус А



Колтивирусы

Вирус колорадской клещевой лихорадки



Аквареовирусы

Реовирусы рыб А


Семейство

Подсемейство

Род

Типовой вид

Бирнавирусы


Авибирнавирусы

Вирус бурсальной болезни птиц


Аквабирнавирусы

Вирус некроза поджелудочной железы лососевых рыб

Парамиксо-
вирусы

Парамиксо-
вирусы

Респировирусы

Вирус Сендай


Морбилливирусы

Вирус кори


Рубулявирус

Вирус паротита


Возможно новый вид

Австралийский морбилливирус лошадей

Пневмо
вирусы

Пневмовирусы

Респираторно-синцитиаль- ный вирус человека


Метапневмовирусы

Вирус ринотрахеита индеек

Рабдовирусы


Везикуловирусы

Вирус везикулярного стоматита Индиана

Лиссавирусы

Вирус бешенства

Эфемеровирусы

Вирус эфемерной лихорадки крупного рогатого скота

Новирабдовирусы

Вирус некроза гемопоэти- ческой системы рыб

Филовирусы


Марбург-подобные
вирусы

Вирус Марбурга

Эболаподобные вирусы

Вирус Эбола

Борнавирусы


Борнавирусы

Вирус болезни Борна

Ортом иксо- вирусы


Грипп А

Вирус гриппа А

Грипп В

Вирус гриппа В

Грипп С

Вирус гриппа С

Тоготовирусы

Вирус Тогота

Буньявирусы


Буньявирусы

Вирус Буньямвера

Хантавирусы

Вирус Хантаан

Наировирусы

Вирус болезни Найроби овец

Флебовирусы

Вирус лихорадки долины Рифт

Аренавирусы


Аренавирусы

Вирус лимфоцитарного хориоменингита

Корона-
вирусы


Коронавирусы

Вирус инфекционного бронхита кур

Торовирусы

Вирус Берне


Семейство

Подсемейство

Род

Типовой вид

Артери-
вирусы


Артеривирусы

Вирус артериита лошадей

Пикорна-
вирусы


Энтеровирусы

Полиовирус человека 1

Риновирусы

Риновирус человека 1А

Гепатовирусь!

Вирус гепатита А человека и обезьян

Кардиовирусы

Вирус энцефаломиокардита

Афтовирусы

Вирус ящура 0

Парэховирусы

Парэховирус человека

Клицивирусы


Везивирусы

Вирус везикулярной экзантемы свиней

Лаговирусы

Вирус геморрагической болезни кроликов

Норволк-подобные
вирусы

Вирус Норволк

Саппоро-подобные
вирусы

Вирус Саппоро

Астровирусы


Астровирусы

Астровирус человека

Флавивирусы


Флавивирусы

Вирус желтой лихорадки

Пестивирусы

Вирус диареи крупного рогатого скота

Гепацивирусы

Вирус гепатита С

Тогавирусы


Альфавирусы

Вирус Синдбис

Рубивирусы

Вирус краснухи

Нодавирусы


Бетанодавирусы

Вирусы некроза нервной ткани морских рыб

«Плавающий» род Дельтавирусы

Вирус гепатита Дельта

«Плавающий» род вирусов, подобных | вирусу гепатита Е

Вирус гепатита Е


Семейство

Вирион

Нуклеокапсид

Геном

Диаметр
(нм)

Обо-
лом
ка

Симметрия

Структурных субъединиц

Природа (конформация, кол- во сегментов)

Размер (тн, тпн)

Вирусы оспы

250x200x200

+

сложная

ни?

дц, линейная

170-250

Асфаровирусы

175-215

+

икосаэдр

gt;1892

дц, линейная

170-190

Иридовирусы

130-300

+

икосаэдр

1892

дц,линейная

150-350

Герпесвирусы

150

+

икосаэдр

162

дц,линейная

125-235

Аденовирусы

80-100

-

икосаэдр

252

дц,линейная

36-44

Полиома- в и русы

45


икосаэдр

72

ДЦ,
циркулярная

5

Папиллома-
вирусы

55


икосаэдр

72

ДЦ,
циркулярная

8

Парвовирусы

25


икосаэдр

32

ОЦ(-),
линейная

5

Цирковирусы

17-22


икосаэдр

32

оц(+),
циркулярная

1,7-2,3

Гепадна-
вирусы

42


икосаэдр

9

дц,
циркулярная

3,2

Ретровирусы

80-100

+

икосаэдр

?

оц(+),
линейная

7-11

Реовирусы

60-80


икосаэдр

92

дц, линейная, 10, 11 или 12 сегментов

16-27

Бирнавирусы

60


икосаэдр

92

дц, линейная, 2 сегмента

7

Парамиксо-
вирусы

150-300

+

спиральная

ни

оц(-),
линейная

15-16

Рабдовирусы

180x75

+

спиральная

ни

оц(-),
линейная

13-16

Филовирусы

790-970x80

+

спиральная

ни

ОЦ(-),
линейная

19

Борнавирусы

50-60

+

икосаэдр

?

оц(-),
линейная

8,9

Ортомиксо-
вирусы

80-120

+

спиральная

ни

оц(-), линейная, 6, 7 или 8 сегментов

10-13,6

Буньявирусы

80-120

+

спиральная

ни

оц(—), линейная, 3 сегмента

11-21

Аренавирусы

100-300

+

спиральная

ни

оц(—), линейная, 2 сегмента

10-14


Семейство

Вирион

Нуклеокапсид

Геном

Диаметр
(им)

Обо
лоч
ка

Симметрия

Структурных субъединиц

Природа (конформация, кол- во сегментов)

Размер (ти, тпи)

Корона-
вирусы

80-220

+

спиральная

ни

оц(+),
линейная

20-32

Артеривирусы

50-70

+

икосаэдр

ни

оц(+),
линейная

15

Пикорна-
вирусы

28-30


икосаэдр

60

оц(+),
линейная

7,2-8,4

Калици-
вирусы

30-38


икосаэдр

32

оц(+),
линейная

7,4-7,7

Астровирусы

28-30

-

икосаэдр

32

оц(+),
линейная

7,2-7,9

Тогавирусы

70

+

икосаэдр

60

оц(+),
линейная

9,7-11,8

Флавивирусы

45-60

+

икосаэдр

?

оц(+),
линейная

9,5-12,5

Нодавирусы

36-43

+

?

?

оц(-),
циркулярная

1,7

Источник: В.А. Сергеев, Е.А. Непоклонов, Т.И. Алипер, «Вирусы и вирусные вакцины» 2007

А так же в разделе «  Классификация вирусов  »